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疫情正還在整治中等待收束,如今我們已經(jīng)清楚,讓南京機(jī)場(chǎng)暫時(shí)“失守”的新冠病毒,名叫德爾塔(Delta)變種。
一天前(8月2日),鄭州、海南等地接連發(fā)布公告,稱確認(rèn)感染者感染的病毒為德爾塔變種。
三天前(7月31日)國(guó)家衛(wèi)生健康委疾控局一級(jí)巡視員賀青華在國(guó)務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機(jī)制召開的新聞發(fā)布會(huì)現(xiàn)場(chǎng),明確說(shuō)明,德爾塔變異株具有病毒載量高、傳播能力強(qiáng)、傳播速度快,而且轉(zhuǎn)陰時(shí)間長(zhǎng)等特點(diǎn)。
密集的信息在日常生活中連連襲來(lái),全部圍繞著它——德爾塔變種。它是最初版新冠病毒的“雙胞胎”兄弟,帶著同樣的感染面具,卻擁有更強(qiáng)的“殺傷力”。
世界衛(wèi)生組織(WHO)流行病學(xué)家Maria van Kerkhove這樣形容它,德爾塔變種的傳染力比2019年底首次出現(xiàn)的原始毒株高出約50%,迄今已有部分國(guó)家通報(bào)住院率上升,但值得慶幸的是尚未觀察到德爾塔變種導(dǎo)致更高死亡率。
德爾塔變種一出,眾多研究人員試圖破解它的感染密碼。最近,Nature給出了答案,科學(xué)家回答了三個(gè)問(wèn)題,新冠病毒是如何感染人體的?為什么德爾塔變種會(huì)具備如此“駭人”的傳染力?最重要的是,未來(lái),我們又該如何應(yīng)對(duì)它。
德爾塔背后的秘密
變異毒株的產(chǎn)生是病毒自我復(fù)制過(guò)程中發(fā)生突變的結(jié)果。病毒一生中會(huì)不斷復(fù)制自己,期間經(jīng)常會(huì)發(fā)生突變,產(chǎn)生變異毒株,復(fù)制越多,感染人數(shù)越多,發(fā)生突變的幾率和出現(xiàn)變異的數(shù)量越大。
一切的根由源自基因,德爾塔病毒由原始病毒基因突變而來(lái),這些突變可能會(huì)影響病毒的“適應(yīng)性”,即其繁殖和傳播的能力。
突變是隨即發(fā)生的,后續(xù)的效果也像“開盲盒”一樣充滿不確定性,有些突變削弱了病毒的毒性,有些突變不會(huì)產(chǎn)生多少影響,有些則使其毒性更加強(qiáng)大。
其實(shí),德爾塔病毒是眾多突變中的一種,突變家族中還包含在英國(guó)占主導(dǎo)的阿爾法(Alpha)變體,以及首先在巴西占主導(dǎo)的伽馬(Gamma)變體。
突變并非冠狀病毒獨(dú)有,每個(gè)流感季節(jié)都會(huì)增加病毒適應(yīng)性,這就是為什么某些流感病毒的突變可能比其他突變傳播得更廣泛。但一種突變成功出現(xiàn)并取代了另一個(gè)變種,并不一定意味著它一定更具傳染性或更致命,只能說(shuō),病毒的突變是為了讓自己更加具備適應(yīng)性。
不過(guò),德爾塔突變走上了更具傳染性的那條路。
據(jù)現(xiàn)有數(shù)據(jù),德爾塔毒株對(duì)公共健康的威脅更大:傳播率比阿爾法變種高約 60%,阿爾法的傳播率比新冠病毒原始毒株高 50%,原因在于新冠病毒表面的蛋白結(jié)構(gòu)發(fā)生的變化。
科學(xué)家認(rèn)為,新冠病毒有一個(gè)豪華的“糖衣”,被稱為聚糖(Glycan),它包裹著新冠病毒表面的標(biāo)志性尖峰蛋白(Spike-protein,也稱S蛋白)。
許多病毒都有糖類覆蓋其外部蛋白質(zhì),它們像“披著羊皮的狼”一樣將病毒在人類免疫系統(tǒng)中偽裝。去年,海外的研究人員根據(jù)結(jié)構(gòu)和基因數(shù)據(jù),通過(guò)超級(jí)計(jì)算機(jī)逐個(gè)原子地渲染,創(chuàng)造了糖衣最詳細(xì)的可視化模型。
研究人員將模擬結(jié)果發(fā)布到Twitter上。一小時(shí)內(nèi),一位研究人員在評(píng)論中問(wèn)道:從蛋白質(zhì)頂部伸出來(lái)的裸露的、沒有涂層的環(huán)是什么?(下圖中紅圈標(biāo)記部位)
研究人員Rommie Amaro的Twitter內(nèi)容,圖源:相關(guān)人Twitter
十分鐘后,德克薩斯大學(xué)奧斯汀分校的結(jié)構(gòu)生物學(xué)家Jason McLellan回復(fù)說(shuō):未包被的環(huán)是受體結(jié)合域 (RBD),是與人體細(xì)胞受體結(jié)合的三個(gè)尖峰部分之一。
受體結(jié)合域,顧名思義,病毒和人體內(nèi)受體結(jié)合的區(qū)域,病毒進(jìn)入人體后,首先會(huì)尋找人體內(nèi)的受體,病毒蛋白和受體之間的關(guān)系類似“鎖”和“鑰匙”,二者結(jié)合配對(duì)后,感染過(guò)程隨即發(fā)生。
因此,受體結(jié)合域是病毒蛋白最先接觸人體細(xì)胞的地方,任何讓病毒更容易進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)的變異都會(huì)讓它更具優(yōu)勢(shì)。
S蛋白的結(jié)構(gòu)圖,可見受體結(jié)合域所在區(qū)域、聚糖包裹區(qū)域。蛋白共包含的三個(gè)區(qū)域:受體結(jié)合域,S1和S2區(qū)域,圖源:Nature
詳細(xì)結(jié)構(gòu)解析的背后,隱藏著德爾塔病毒的秘密。
科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)德爾塔具備關(guān)鍵的適應(yīng)性,這些適應(yīng)性可以幫助病毒以驚人的力量“捕捉”人體細(xì)胞,并在細(xì)胞中隱藏自己。當(dāng)病毒離開細(xì)胞時(shí),新冠病毒執(zhí)行了一個(gè)關(guān)鍵的處理步驟——準(zhǔn)備更多的感染顆粒,去感染更多的人類細(xì)胞,這是使該病毒能夠如此迅速傳播的原因。
倫敦帝國(guó)學(xué)院的病毒學(xué)家Wendy Barclay說(shuō):“這也是為什么它如此難以控制的原因之一。”
每個(gè)病毒顆粒的外表面都有24-40個(gè)雜亂無(wú)章的尖峰蛋白,這是病毒與人類細(xì)胞融合的關(guān)鍵。 對(duì)于其他類型的病毒(如流感),外部融合蛋白是相對(duì)剛性的。然而,根據(jù)德國(guó)法蘭克福馬克斯·普朗克生物物理研究所的生物化學(xué)家Martin Beck和他的同事在2020年8月發(fā)表的論文記載,新冠病毒的尖峰是非常靈活的,在三個(gè)點(diǎn)上存在錨點(diǎn)(上圖中的I、II、III三個(gè)點(diǎn)位)。
這使得尖峰蛋白可以翻來(lái)覆去地?fù)u擺和旋轉(zhuǎn),這可能讓它們更容易觸碰人體細(xì)胞表面,并讓多個(gè)錨點(diǎn)與人體細(xì)胞結(jié)合。
新冠病毒的計(jì)算機(jī)模擬結(jié)構(gòu),可以看出表面的尖峰蛋白的形態(tài)相當(dāng)多變,這讓其與人體細(xì)胞結(jié)合的方式也更加多樣,圖源:Nature
Wendy Barclay說(shuō),目前還沒有其他冠狀病毒的類似實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),但由于尖峰蛋白序列在進(jìn)化上高度保守,可以假設(shè)這一特性是共享的——冠狀病毒共享同樣的模型。
新冠肺炎爆發(fā)的早期,研究人員曾證實(shí)新冠病毒尖峰蛋白的受體結(jié)合域附著在一種被稱為ACE2受體蛋白質(zhì)上,該受體大量存在于人類咽喉和肺部細(xì)胞的外部,ACE2受體和受體結(jié)合域就是那對(duì)“鎖”和“鑰匙”。
ACE2受體也是嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合癥(非典型性肺炎,SARS)的主要結(jié)合點(diǎn),但與SARS相比,新冠病毒與ACE2的結(jié)合強(qiáng)度要大2-4倍。
新冠病毒的變異往往在尖峰蛋白的S1亞基上發(fā)生突變,該亞基承載著受體結(jié)合域,負(fù)責(zé)與ACE2受體結(jié)合,其中,第二個(gè)尖峰亞單位S2,促使病毒與宿主細(xì)胞的膜融合。
目前,正在世界各地傳播的德爾塔變體在S1亞單位中發(fā)生了多個(gè)突變(包括受體結(jié)合域中的三個(gè)突變),這些突變似乎提高了其與ACE2結(jié)合以及逃避免疫系統(tǒng)的能力。
德爾塔究竟是怎樣感染人體的?
經(jīng)過(guò)突變,德爾塔擁有了更強(qiáng)的“穿透”和結(jié)合力,接下來(lái),它開始大刀闊斧的進(jìn)軍人體細(xì)胞。一旦病毒尖峰與ACE2受體結(jié)合,宿主細(xì)胞表面的其他蛋白質(zhì)就會(huì)啟動(dòng)一個(gè)過(guò)程,導(dǎo)致病毒和細(xì)胞膜的合并。
SARS病毒使用兩種宿主蛋白酶中的其中之一作為通道進(jìn)入人體:TMPRSS2(發(fā)音為tempress two)或cathepsin L。TMPRSS2是更快的進(jìn)入途徑,但SARS病毒經(jīng)常通過(guò)內(nèi)體(一個(gè)被脂質(zhì)包圍的氣泡)進(jìn)入,這一過(guò)程依賴cathepsin L蛋白酶,當(dāng)病毒通過(guò)這種途徑進(jìn)入細(xì)胞時(shí),抗病毒蛋白可以捕獲它們。
與SARS不同,新冠病毒更“有效”地利用了TMPRSS2,TMPRSS2在呼吸道細(xì)胞外部大量存在,以此迫使病毒膜和細(xì)胞膜融合在一起。
隨后,病毒將其基因組直接射入細(xì)胞。根據(jù)Barclay等人4月份發(fā)表的工作報(bào)告,通過(guò)這種彈簧式的入侵方式,新冠病毒的感染速度比SARS更快,并可以免于被困于人內(nèi)體。(邯鄲做小程序)
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