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香港大學尹國圣教授發(fā)布新冠肺炎AI成果,準確率達88%

發(fā)布時間:2020-05-23 12:02:55來源:雷鋒網(wǎng)

  近日,香港大學統(tǒng)計與精算學系系主任尹國圣教授聯(lián)合其他多位學者發(fā)表一篇最新論文,介紹了一個最新的新冠肺炎在線診斷系統(tǒng)。據(jù)了解,該系統(tǒng)對新冠肺炎診斷的準確率 88%、AUC 值 93%、敏感度 86%、特異度 90%,

  參與這項研究的人員,還有西南財經(jīng)大學統(tǒng)計學院助理教授劉斌博士、研究生高曉雪、何孟霜、劉霖以及劉斌博士的同事呂鳳毛(西南財經(jīng)大學統(tǒng)計學院助理教授)。

  目前,論文正在評審中,但是 COVID-19 診斷系統(tǒng)已經(jīng)在線、免費使用,Python 程序及數(shù)據(jù)完全開源

  尹國圣教授表示,通過對非典疫情及各類流感病毒的研究,香港大學一直都走在世界科研的最前沿。2003 年非典期間,深圳和香港的科研人員就曾聯(lián)合宣布,從果子貍等野生動物體內(nèi)找到非典病毒前體。

  基于生物統(tǒng)計和臨床試驗方向的多年研究經(jīng)驗,從 2020 年 1 月底,尹國圣教授帶領(lǐng)的研究團隊開始嘗試一些新冠肺炎方面的研究,基于 CT 圖像診斷是其中一項工作。

  但是,由于沒有公開的 CT 圖像數(shù)據(jù)集,團隊需要花大量的時間去尋找開放的樣本并對樣本進行標記。

  后來,medRxiv 上有一項工作,整理了一些關(guān)于新冠病人 CT 圖像分析的論文預印本。該論文從 medRxiv 和 bioRxiv 文章的預印本中提取了 746 張病人的 CT 圖像,并訓練了一個新冠病人二分類的神經(jīng)網(wǎng)絡。

  然而,其結(jié)果顯示的預測效果還未能達到臨床標準。

  尹國圣教授認為,一個原因是樣本量較小,另一個重要原因是沒有充分利用 CT 圖像樣本自身豐富的標注信息。這批 CT 數(shù)據(jù)跟傳統(tǒng)的醫(yī)療圖像數(shù)據(jù)最大的差別是,每個樣本都來自一篇醫(yī)學影像學論文。

  在這些文章中,臨床醫(yī)生對新冠病人的胸部 CT 病灶特征做了詳細的描述,有些還和其他常見肺部疾病的病灶特征做了仔細的對比分析。

  因此,在尹教授看來,“這批數(shù)據(jù),雖然樣本數(shù)量有限,但信息量極大,是一個具有代表性,價值很高的數(shù)據(jù)集。”

  研究人員進一步對樣本附帶的文本信息進行了針對性的研究,發(fā)現(xiàn) 760 篇論文涵蓋了對于新冠肺炎的五種病灶(Lesion)的描述,其中每個病人 CT 影像上均會出現(xiàn)其中一種或者多種病灶。通過對新冠確診病人的 CT 圖像的診斷描述進行分析,這五種病灶是影像學上對新冠肺炎診斷的主要標準。

  于是,團隊設(shè)計出一個基于 CT 圖像的 Lesion-Attention 深度神經(jīng)網(wǎng)絡模型(LA-DNN)。

  模型一方面學習圖像中可以區(qū)分新冠病人和非新冠病人的特征,另一方面把模型的“注意力”集中在病灶區(qū)域,即學習多標簽病灶,這就是團隊提出的 LA-DNN(Lesion-Attention Deep Neural Networks)模型,如同臨床醫(yī)生通過 CT 圖像判斷病情時會側(cè)重關(guān)注異常的病灶區(qū)域而略過正常區(qū)域一樣,模型同時訓練兩個任務,相互協(xié)調(diào),從而使得模型性能得到顯著的提升,其各項指標均達到了臨床標準。

  同時,團隊也采用了遷移學習,即利用預訓練的 VGG、DenseNet 等神經(jīng)網(wǎng)絡來作為模型的骨干網(wǎng)絡。

  新冠 CT 圖像診斷系統(tǒng)上線后,團隊仍然在繼續(xù)收集新的樣本,在線系統(tǒng)的訓練樣本比最初的樣本數(shù)量翻了一倍,并定期重新訓練模型,在線系統(tǒng)的效果比論文中的結(jié)果又有提升。

  對于該成果未來的應用方向,尹教授表示,希望前線抗擊疫情的醫(yī)務人員使用該系統(tǒng),分享數(shù)據(jù)、開展合作研究,幫助進一步測試和改進系統(tǒng)。

  “目前,中國的疫情得以控制,而其他許多國家和地區(qū)仍然存在很大壓力,希望該系統(tǒng)可以在疫情仍然嚴重的區(qū)域發(fā)揮作用,減輕核酸檢測的負擔。”
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