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谷歌AI可預(yù)測(cè)新冠病毒蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu) 或有助于遏制全球爆發(fā)

發(fā)布時(shí)間:2020-03-07 10:07:18來(lái)源:騰訊科技

  3 月 6 日消息,據(jù)外媒報(bào)道,谷歌旗下人工智能(AI)部門 DeepMind 正在加入全球努力,以幫助了解更多關(guān)于新型冠狀病毒的信息,這種病毒引發(fā)的疫情正在世界大部分地區(qū)迅速傳播。

  谷歌的英國(guó)研究團(tuán)隊(duì)剛剛使用 DeepMind 的新深度學(xué)習(xí)系統(tǒng) AlphaFold 預(yù)測(cè)新型冠狀病毒的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。該系統(tǒng)使用被稱為“自由建模”的機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù),當(dāng)沒(méi)有類似的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可用時(shí),它可以自主生成新的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。

  據(jù)最新統(tǒng)計(jì),世界各地的科學(xué)家都在竭盡全力了解這種新病毒,DeepMind 的發(fā)現(xiàn)希望減少確定病毒蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的時(shí)間。

  DeepMind 發(fā)布的博客文章指出:“了解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)將為了解其功能提供重要線索,但確定結(jié)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)往往可能需要幾個(gè)月或更長(zhǎng)的時(shí)間,有些實(shí)驗(yàn)甚至被證明難以獲得結(jié)果。為此,研究人員始終在開發(fā)從氨基酸序列預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的計(jì)算方法。在類似蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)已經(jīng)被實(shí)驗(yàn)確定的情況下,基于“模板建模”的算法能夠提供對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的準(zhǔn)確預(yù)測(cè)。”

  文章中還稱:“我們最近發(fā)布的深度學(xué)習(xí)系統(tǒng) AlphaFold 專注于在沒(méi)有相似蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的情況下準(zhǔn)確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),這種方式被稱為“自由建模”。自推出以來(lái),我們始終在持續(xù)改進(jìn)這些方法,并希望提供最有用的預(yù)測(cè),所以我們分享了使用我們新開發(fā)的方法生成的 SARS-CoV-2 中某些蛋白質(zhì)的預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)。”

  值得注意的是,DeepMind 的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)系統(tǒng)仍在開發(fā)中,他們不能確定所提供的結(jié)構(gòu)的準(zhǔn)確性,盡管他們相信該系統(tǒng)比早期的 CASP13 系統(tǒng)更準(zhǔn)確。DeepMind 證實(shí),其系統(tǒng)為蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)中共享的、經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的 SARS-CoV-2 尖峰蛋白結(jié)構(gòu)提供了準(zhǔn)確的預(yù)測(cè),這讓他們相信對(duì)其他蛋白質(zhì)的模型預(yù)測(cè)可能是有用的。

  鑒于“疫情的潛在嚴(yán)重性和時(shí)間敏感性”,DeepMind 表示,該公司正在跳過(guò)通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)的過(guò)程,或者在發(fā)表之前等待學(xué)術(shù)期刊的同行評(píng)審。這與其他科學(xué)研究相一致,因?yàn)檫@個(gè)過(guò)程可能需要幾個(gè)月的時(shí)間。

  博客文章中還稱:“我們需要強(qiáng)調(diào)下,這些結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)還沒(méi)有經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,但希望它們能有助于科學(xué)界了解病毒是如何發(fā)揮作用的,并為未來(lái)開發(fā)療法的實(shí)驗(yàn)工作提供假說(shuō)生成平臺(tái)。我們感謝許多其他實(shí)驗(yàn)室的工作:如果沒(méi)有全球研究人員的努力,這項(xiàng)工作是不可能完成的。”

  文章補(bǔ)充道:“通常情況下,我們會(huì)等到一家學(xué)術(shù)期刊對(duì)這項(xiàng)工作進(jìn)行同行審查后再發(fā)表相關(guān)發(fā)現(xiàn)。然而,考慮到情況的潛在嚴(yán)重性和時(shí)間敏感性,我們將按照現(xiàn)在的情況發(fā)布預(yù)測(cè)的結(jié)構(gòu),并以開源的形式推出,這樣任何人都可以使用它們。”開源將允許任何研究人員在 DeepMind 發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)上進(jìn)行改進(jìn)或分享。

  谷歌在 2014 年斥資 4 億英鎊收購(gòu)了總部位于倫敦的 DeepMind,該公司此前曾使用 AI 推動(dòng)醫(yī)療保健領(lǐng)域的進(jìn)步,開發(fā)用于識(shí)別眼病和檢測(cè)宮頸癌的模型。
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